鉆井除泥器與除砂器同屬離心式凈化設備，核心原理均為離心沉降，但針對細顆粒的分離特性，其結構參數與運行機制更具針對性，整個凈化過程分為三個關鍵環節：
首先是加壓進料環節，經振動篩、除砂器預處理后的鉆井液，由專用渣漿泵以0.25-0.35MPa的壓力、6-9m/s的流速，沿旋流器切線方向高速射入，在筒體內迅速形成螺旋狀渦流場。相較于除砂器，除泥器的旋流器直徑更小，因此能產生200-400倍于重力的離心力——這是實現細顆粒分離的核心保障。
其次是分級分離環節，在強大離心力作用下，密度略高于鉆井液的泥質顆粒、細砂被甩向旋流器內壁，沿錐形筒壁做螺旋下降運動，形成“外螺旋流”；而凈化后的鉆井液則向中心軸匯聚，形成流速較慢的“內螺旋流”向上攀升。這一過程中，5μm以上的細顆粒被捕獲，避免其在鉆井液中累積。
是排放環節，細顆粒固相從旋流器底部的底流口排出，形成濃度較高的“泥膏狀”底流，經收集槽導入振動篩進行二次處理；凈化后的鉆井液則從頂部溢流口流出，進入除砂除泥一體機的儲漿罐，或直接輸送至下一級凈化設備（如離心機）進行超精細處理，完成鉆井液的循環復用。
鉆井除泥器的結構設計圍繞“細顆粒分離”與“穩定運行”展開，主要由動力模塊、分離模塊、收集模塊及控制模塊組成，各部分協同實現凈化：
- 渣漿泵：作為動力核心，采用高耐磨過流部件（如高鉻合金葉輪），具備高揚程（25-35m）、大流量特性，能穩定提供高壓進料動力，避免因壓力波動導致的分離效率下降。單臺除泥器通常配套1-2臺渣漿泵，適配不同鉆井液排量需求。
- 旋流器組：分離功能的核心，采用直徑50-100mm的小尺寸旋流器，單臺處理量5-15m3/h，實際應用中多以6-12臺并聯組成旋流器組，總處理量可達30-180m3/h。旋流器內壁襯有聚氨酯或陶瓷耐磨層，有效抵抗細顆粒沖刷，延長使用壽命。
- 底流收集系統：由集液槽、導流板、振動篩銜接裝置組成，采用傾斜式設計確保底流順暢排出，同時避免凈化后的鉆井液與底流混合污染。部分高端設備配備底流濃度傳感器，實時監測分離效果。
- 控制系統：包含壓力儀表、流量調節閥門及啟停控制單元，操作人員可通過監控進料壓力（穩定在0.3MPa左右）判斷分離狀態，當壓力過高時及時調整閥門，確保設備穩定運行。