除砂器的核心工作原理是離心沉降。其工作流程如下：
進料：被泥漿泵吸入的、含有鉆屑的鉆井液在一定的壓力下，從除砂器側面沿切線方向進入錐形旋流器的進料口。
旋流產生：鉆井液在圓筒段和錐形段內高速旋轉，形成強烈的螺旋流。在離心力的作用下，密度較大的固體顆粒被甩向旋流器的內壁。
分離：
底流（排砂口）：在離心力和自身重力的共同作用下，沿內壁旋轉向下的固體顆粒從錐體底部的細小出口（底流口）排出。排出的通常是較粗的顆粒和少量液體，形態像“傘”狀。
溢流（排液口）：經過凈化的、相對清潔的鉆井液以及大部分液體，在旋流器中心形成一個向上的內旋流，從頂部的中心管（溢流管）排出，返回循環系統繼續使用。