錦鯉主要觀賞背面，所以選擇上下較扁、剖面是扁橢圓形、整體呈紡錘形的，而色彩則根據培育目的來選擇相應體色的親魚。例如，要培養紅白錦鯉，就應從紅白品系中選擇健康的雌、雄魚作親魚。如果在培養繁殖用錦鯉時，將不同品系親魚放在一口大魚塘中任其自然繁殖，這樣顯然不能獲得滿意的結果。
孵化池3m×3m，水深30cm。水溫要與產卵池水溫相近，溫差不得超過5℃。孵化時間的長短與水溫相關：水溫18℃，約經5天孵出仔魚；水溫20℃時，約經4天孵出仔魚；20℃～22℃時，3天～4天仔魚可孵出；25℃時3天仔魚孵出。剛孵出仔魚的習性與金魚仔魚相似，喂養方法也大致相同。
同時將雄魚的精液擠于其上，用過的羽毛輕輕攪拌，使之授精，2分鐘～3分鐘后，即將受精卵均勻地倒入預先置于淺水臉盆的魚巢上，靜置十幾分鐘后待受精卵粘固，用清水洗去精液，即可進行孵化。
紅白系錦鯉中應淘汰紅斑紋顏色淡的個體；黃金系錦鯉頭部無光澤、鱗片覆蓋不好、魚體雜斑多、胸 鰭生長不好的個體均應淘汰。錦鯉在飼養過程中淘汰率很高：親魚產10萬粒卵，獲仔魚6萬尾～7萬尾，夏花3萬尾，經次挑選剩1.6萬尾，到秋季越冬時只剩3600尾左右。