無菌實驗室主要由六大部分組成，即：準備室、洗滌室、室、無菌室、恒溫培養室、普通實驗室。其中無菌室的外間應配有緩沖室。所有的房間面積不宜過大，吊頂不宜過高，以便于進行空氣。無菌實驗室的主要布局要求有如下幾點：
· 入口避開走廊，設在檢驗操作室內；
· 與操作室用兩道緩沖間隔開；
· 無菌室與緩沖間均須裝有紫外燈，要求每3平米安裝30w紫外燈一盞；
· 無菌室內設有實驗臺*(實驗臺與邊臺皆可)，紫外燈距實驗臺面要小于1.5m；
· 無菌室與操作室之間設有雙層窗構成小通道。
電源：要求提供穩壓、恒頻的電源；根據儀器設備要求，必要時配備不間斷電源。
水源：操作區內須設置水源。用于標本處理（如染色）的水槽與工作人員洗手用的水槽不能混用。
無菌室僅用于培養基分裝等無菌操作，不能進行有菌標本的操作。操作人員操作時應嚴格關門，并戴好專用的口罩、帽子。
無菌室內應有空氣過濾裝置，并安裝空調。
大粒子超標的原因一般在高等級的潔凈室中出現，如果房間清潔效果不好會直接影響到檢測結果；本次系統設計潔凈度為萬級，按實際理論分析該潔凈等級應該很好達到，通過風量數據以及以往工程經驗分析，部分房間理論測試結果應為千級；本人在接到公司測試結果不達標后趕赴現場，負責查找原因及分析。