使用目的不同：生物實驗室是為了保護操作者和實驗室外的人員不受感染。生物控制。普通潔凈實驗室是為了保護產品不受污染。室內環境控制。 實現方法不同：生物實驗室相對大氣為負壓，對室內壓力及相鄰房間的壓力梯度嚴格控制，控制室內氣流流向。采用全新風送風，排風及送風均采用雙風機系統，一用一備，自動投入運行。排風系統要加HAPE過濾器。自控要求較高。普通潔凈實驗室相對大氣為正壓且壓力差值較小，對室內壓力及相鄰房間的壓力梯度控制要求較低。一般采用新風+回風的送風系統，送風及排風系統均不用風機。排風系統不加HAPE過濾器。自控要求相對較低。 運行模式不同：生物實驗室的運行模式一般有正常運行模式、值班運行模式、運行模式；根據實驗室使用方式及方法的不同，對室內的條件控制及風量控制有所不同。一般潔凈實驗室的運行模式一般僅有正常運行模式，要求條件高的項目才會有值班運行模式，一般不會考慮運行模式。
三種常用潔凈實驗室凈化空調系統
1、直流式凈化空調系統
直流式系統就是不用回風循環系統，也就是直送直排系統，其能耗很大。這種系統一般適用于有致敏性的生產工藝（如青霉素分裝工藝）、實驗動物房、生物潔凈室（實驗室）及能形成交叉污染生產工藝。采用這種系統時應考慮余熱的回收。
2、全循環式凈化空調系統
全循環式系統即無新風供給，也無排風的系統。這種系統無新風負荷，很節能，但室內空氣品質差，壓差不好控制，一般適用于無人操作、值守的潔凈室。
3、部分循環式凈化空調系統
這是用得最多的系統形式，也就是有部分回風參與循環的系統。在系統中，新風和回風混合經處理送到無塵潔凈室內，回風的一部分用于系統循環，另一部分被排走。該系統壓差易于控制，室內品質較好，能耗介于直流式系統與全循環式系統之間，適用于允許采用回風的生產工藝。
(1)注意潔凈室周圍的環境衛生，防止粉塵等物質產生；(2)注意檢查初、中效的壓差，當其壓差大于初始壓差的2倍時應對濾布進行清洗；(3)初、中濾布清洗時，不用洗衣粉，選擇清洗劑。
我們根據上述要點完成15個食品行業潔凈室的施工，且驗收合格。無塵車間采用高壓靜電吸附除塵，靜電場中的陰極線在高壓靜電的作用下，產生電暈放電，電暈層中產生大量的負離子，負離子在靜電場的作用下，不斷地向陽極運動。當空氣中粉塵通過電場時，粉塵受到負離子的碰撞帶上電荷，帶上電荷后的粉塵同樣受到靜電場的作用，向陽極（集塵極）運動，到達陽極后釋放電荷。食用菌凈化車間快速實現空間環境凈化,是傳統空氣凈化投資的20%，又能達到百級凈化標準，不用任何化學、沒有化學藥劑殘留。一年節省的藥劑，即可以買一臺設備，適于標準化食用菌廠和栽培戶冷卻室、接種室、菇房。
生產車間應根據工藝流程進行布置，避免重復往返，防止原材料，半成品和成品的交叉污染和混合。
地面應鋪以吸水、不透水、防滑、防腐的材料。它沒有裂縫，易于清洗和。地面應有1%-2%的坡度和排水系統，保證排水暢通，地面無積水；車間下水道應有可靠的液封裝置。
墻面應由不透水、不吸水、耐洗、防滲材料組成，表面光滑、無裂縫，刷色淺、、不易脫落、易于清洗、、。墻角應該是弧形的。
門應具有光滑，不吸水的表面，緊密關閉，并根據每個車間的實際需要設置防飛設施，如紗門，屏風，水幕和氣簾。
窗臺高度超過1米，內窗臺向下傾斜45度。
天花板應防止灰塵堆積，霉菌生長和材料剝落，易于清洗，不凝結水。
