微生物檢測方法有空氣懸浮微生物法和沉降微生物法兩種，采樣后的基片（或平皿）經過恒溫箱內３７℃、４８h的培養生成菌落后進行計數。使用的采樣器皿和培養液必須進行處理。采樣點可均勻布置或取代代表性地域布置。
潔凈室懸浮微生物法應采用離心式、狹逢式和針孔式等碰擊式采樣器，采樣時間應根據空氣中微生物濃度來決定，采樣點數可與測定空氣潔凈度測點數相同。各種采樣器應按儀器說明書規定的方法使用。沉降微生物法，應采用直徑９０mm培養皿，在采樣點上沉降３０mm后進行采樣，培養皿最少采樣數應符合表Ｂ.５.２的規定。
背壓補償模式測試：為了使測得風量值更接近于風量的真實值，減小由于風量罩對系統造成壓損而產生的測試誤差。建議在風量大于1500 m/h時采用背壓補償模式測試,
1）當測試模式為“B.Press”時，按下“START”鍵儀器開始測量，風量穩定后測試自動停止。
2）界面提示“打開背壓板”，手動把背壓板打開后，按下“START”鍵，儀器開始測試。
3）測試結束后儀器自動停止，顯示經過背壓補償后的風量值。
4）若對停止時的風量進行保存，可以按“SAVE”鍵將本次測得風量值保存，“Cycle”自動加1。
我們所推薦的無塵車間測試項目包括過濾器風速有其均勻性、過濾器安裝檢漏、壓差、氣流平行度、潔凈度、噪聲、光照度、濕／溫度等等。這些是基本的測試項目，它包括了主要的和輔助的測試項目。這些項目應于無塵車間最初設計的標準和參數相一致，測試認證應在無塵車間移交業主前完成。
所有無塵車間測試項目中有4個主要項目（過濾器風速及其均勻性、過濾器安裝檢漏、壓差和潔凈度）是最重要和最基本的。在設備進入無塵車間前必須完成。其它的一些輔助測試項目如氣流平行度（只適用于單向流無塵車間）、溫、濕度、光照度、噪聲也需要完成，因為它們與無塵車間中空氣的運動和環境參數有關。我們認為至少在動態條件下需要做以上這些輔助測試。