微生物檢測方法有空氣懸浮微生物法和沉降微生物法兩種，采樣后的基片（或平皿）經過恒溫箱內３７℃、４８h的培養生成菌落后進行計數。使用的采樣器皿和培養液必須進行處理。采樣點可均勻布置或取代代表性地域布置。
用培養皿沉降菌，用碰撞式采樣器或過濾采樣器測定游浮菌，還應遵守以下規定：
１、采樣裝置采樣前的準備及采樣后的處理，均應在設游空氣過濾器排風的負壓實驗室進行操作，該實驗室的溫度應為２２±２℃；相對濕度為５０％±１０％；
２、采樣儀器應；
３、采樣器選擇應審核其精度和效率，并有合格證書；
４、采樣裝置的排氣不應污染潔凈室；
５、沉降皿個數及采樣點、培養基及培養溫度、培養時間應按有關規范的規定執行；
６、潔凈室浮游菌采樣器的采樣率宜大于１００Ｌ／min；
７、碰撞培養基的空氣速度應小于２０m/s。
所有的無塵車間測試基本上都是基于國際認可的標準（如ISO14644－1；IEST－RP－CC006．2；NEBB手冊和已被終止的FS－209E）。這些標準和慣例對無塵車間的測試和認證提供了最基本的指導。而事實上，無塵車間的業主和承建商因產品，工藝的要求而對無塵車間的技術指標，測試方式和驗收標準有相對于上述標準不同的協議。
我們進行無塵車間氣流流型(單向流)的檢測,明確無塵車間內的設備或設施對氣流的影響,選擇或改善氣流流型使之產生最小的湍流(渦流)，增加無塵車間的自凈能力或恢復率，縮短自凈時間。在紊流潔凈室中，風的輸送和混合都是紊流方式進行的。為確保污染物被清楚，無塵車間的各個部分必須均實現良好的空氣混合。
氣流流形的檢測應按以下步驟進行：
1：布置測點：1)垂直單向流無塵車間選擇縱、橫剖面各一個，以及距地面高度0.8m、1.5m的水平面各一個;水平單向流無塵車間選擇縱剖面和工作區高度水平面各一個，以及距送、回風墻面0.5和房間中心處等3個橫剖面，所有面上的測點間距均為0.2m~1m；2)亂流無塵車間選擇通過代表性送風口中心的縱、橫剖面和工作區高度的水平面各一個，剖面上的測點間距為0.2m~0.5m，水平面上測點間距為0.5m~1m。兩個風口之間的中線上應有測點。
2：測定方法：用發煙器或懸掛單絲線的方法逐點觀察和記錄氣流流向，并可用量角器量出角度，發煙源可用超聲波霧化(0.5um~50um水霧)的去離子(DI)水、噴射方法生成的乙醇或二醇、固態二氧化碳(干冰)等，在高強度光源下示蹤。在確保對人和物無傷害時可以四氯化鈦(TiCl4)作示蹤粒子。