在實際的房室系統（特別是在生理、生態、環境等系統）中,實驗條件是受到限制的。首先,對系統的激勵方式不能是任意的，如在生理系統的實驗中，輸入一般只允許是注射或點滴；其次，各個房室的狀態不一定能夠測量，或者測量到的數據可能很少。在這種情況下，模型的參數能不能被估計出來（得到的估計值），這就是模型結構的可辨識問題。這個問題對房室模型來說十分重要。通過對實際系統的分析建立起房室模型之后，就需要根據實驗條件和測量手段來判斷模型是否具有可辨識性。如果不具有可辨識性，就需要重新考慮模型結構，例如對房室進行化簡、歸并，在新的結構下再來考察可辨識性。模型結構的真實可靠和可辨識性，是在建立模型時必須考慮到的兩個方面。
黏土模型
黏土材料來源廣泛取材方便價格低廉經過“洗泥”工序和“煉熟 過程 其質地更加細膩。黏土具有一定的粘合性 可塑性極強 在塑造過程中可以反復修改 任意調整 修 刮 填，補比較方便。還可以重復使用 是一種比較理想的造型材料,但是如果黏土中的水分失去過多則容易使黏土模型出現收縮 龜裂甚至產生斷裂現象 不利于長期保存 。另外，在黏土模型表面上進行效果處理的方法也不是很多,黏土制作模型時一定要選用含沙量少，在使用前要反復加工，把泥和熟，使用起來才方便。一般作為雕塑、翻模用泥使用。
木制模型
我們使用的木材一般都是經過二次加工后的原木材和人造板材。人造板材常有膠合板、刨花板、細木工板、中密度纖維板等。家具的模型制作常用木頭制作。
金屬模型
以鋼鐵材料應用最多，如各種規格的鋼鐵、管材、板材，有時少量的也用一些鋁合金等其他金屬材料。 金屬模型材料的制作，主要考慮力學性能和成本等方面的因素。力學性能主要從金屬材料的強度、彈性、硬度、剛度以及抗沖擊拉伸的能力等方面來考慮。金屬模型加工工藝主要有切削、焊接、鑄造、鍛造等。因實驗室加工條件有限，所以金屬模型工藝選擇較少。