PCT的主要目的在于，簡化以前確立的在幾個國家申請發明專利保護的方法，使其更為有效和經濟，并有益于專利體系的用戶和負有對該體系行使管理職權的專利局。
在引進PCT體系前，在幾個國家保護發明的方法是向每一個國家單獨提交申請；這些申請由于每一個要單獨處理，因此，每一個國家的申請和審查都要重復。為達到其應有的目的，PCT提出：
——建立一種國際體系，從而使以一種語言在一個專利局（受理局）提出的一件專利申請（國際申請）在申請人在其申請中（指定）的每一個PCT成員國都有效；
——可以由一個專利局，即國際檢索單位對國際申請進行形式審查；
——對國際申請進行國際檢索，并出具檢索報告說明相關的現有技術（與過去的發明相關的已出版的專利文獻），在決定該發明是否具有專利性時可以參考該報告；該檢索報告應首先送達申請人，然后公布；
——對國際申請及其相關的國際檢索報告，進行統一的國際公布并將其傳送給指定局。
——提供對國際申請進行國際初步審查的選擇，供專利局決定是否授予專利權，并為申請人提供一份包含所要求保護的發明是否滿足專利性國際標準的觀點的報告。
通常稱其為PCT程序的“國際階段”，而“國家階段”是指授予專利程序的部分，它是國際申請中指定的國家的國家局或代理行使國家局職能的機構，統稱為指定局。關于國際申請、國際檢索、國際公布是由第I章規定的；國際初審是由第II章規定的。（在PCT專業詞“國家”局，“國家”階段，或"國家"費用也指地區專利局的有關程序）。